國藥中生武招字第（2024）050號

1.目（mù）的

為保證高通（tōng）量測序（NGS）平台運行，服務各科室，羞羞视频在线公司擬采購高通量測序分析係統（轉錄組平台搭建、細菌（jun1）/病毒基因組平台搭建、宏基因組數據平台搭建、宏基因組醫學平（píng）台搭建）。通過本次招標選擇一家符合資質、專業性強、有豐富高通量測序（NGS）平台經驗的公司提供服務。

2.範（fàn）圍

高通量測序（NGS）分析係統（tǒng）包（bāo）含：1、轉錄組平台搭建、細菌/病（bìng）毒基因（yīn）組平（píng）台（tái）搭建、宏基（jī）因組數據平台搭建、宏基因組醫學平（píng）台（tái）搭（dā）建。2、對人員進（jìn）行平台使用和（hé）生（shēng）物信（xìn）息學的培訓。

3.投標（biāo）單位資格

3.1投標單位必須在中國工商行政管（guǎn）理機關登記取得合格有效的（de）營業執照，具有中華人民共和國獨立（lì）法人資格；

3.2投標（biāo）單位必須有相應高通量測序（NGS）相關資質（zhì），在行（háng）業主管（guǎn）部門備（bèi）案且處於有效期內；投標單位的投標人非法人的，應出（chū）具本單（dān）位出（chū）具的法人（rén）代表授權委托書；

3.3投標（biāo）文件中必須有體現公（gōng）司規模、人員（yuán）配備及人員專業性（xìng）的內容。

3.4投標單位應出具企業（yè）高通量測序（NGS）分析能力過往項目業績證（zhèng）明，數量不少於3個（提供（gòng）合同協議書（shū））。

上述資料均（jun1）需加蓋公章，否（fǒu）則視為（wéi）無效投標。

4.服務地點

江（jiāng）夏區鄭店黃金（jīn）工業園路1號羞羞视频在线（hàn）生物製品研究所有限責任公司。

5.服務時間

2025年1月1日-2030年1月1日

6.工作內容及要求

投標方在投標前務必詳細了解用戶需求並到現場實地考察服務器，否則（zé）由此造成的一切後果均由投標方自行承擔。

6.1工作內容

所（suǒ）購高通量測序（NGS）分析係統（tǒng）承擔轉（zhuǎn）錄（lù）組平台（tái）、細菌/病（bìng）毒基因組平台、宏基因組數據平台、宏基因組醫學平台的搭建，為期不（bú）少於3年的免費售後服務（包括軟件係統升級），期間提供甲（jiǎ）方免費上門學習生物信息的知識，及對人員（yuán）進行平台使用的培訓。如果（guǒ）搭建的分析流程不能滿足甲（jiǎ）方分析的需求，乙方需每年提供不超過5次分析的服務。

6.1.1轉錄組平台搭建（jiàn）的內（nèi）容

（1）樣本的相關性分析

（2）樣本的主成分分（fèn）析

（3）差異基（jī）因篩選、差異基（jī）因（yīn）箱圖

（4）差異基因火山圖

（5）差異基因的聚類熱圖

（6）差異基因韋恩圖

（7）差異基因功能富集（GO和KEGG富集分析）

（8）基因結構分析（做成勾選項目）：新轉（zhuǎn）錄本位點分析、UTR分析（xī）、AS分析、SNP與（yǔ）INDEL分析

備注：需添（tiān）加轉錄（lù）組子繪圖功能

6.1.2細菌/病毒基因組（zǔ）平台搭建的內容

組裝出單物種的基因序列：基因組組裝、序列比對、變異位點檢測（突變位點、氨基酸的情況以及整體的突變頻率圖）

常（cháng）規的分析：基因結構注釋和預測、蛋白功能注（zhù）釋和預測（COG聚類圖、KEGG聚類圖、GO聚類圖（tú））、基因組圈圖

6.1.3宏（hóng）基因組數（shù）據平台搭建的內容（róng）

基因（yīn）預測：基因預測基本統計（jì）、基因數目韋（wéi）恩圖分析（xī）、組間基因數目差異分析、基因多樣性分析

物種注釋：物種豐度概況（門、屬、KRONA分析示例圖（tú））、物種相對豐度聚類熱（rè）圖、PCOA分析（xī）、樣本聚類分析、組間物種（zhǒng）差異分析（LEFSE判別分（fèn）析）

功（gōng）能注釋：功（gōng）能豐度概況、功能相對豐度聚類熱圖、功能豐度PCOA分析、基於功（gōng）能豐度的樣本聚類分析、代謝通路比較分析、組間功能差異分析、功能（néng）注釋（shì）分析（注（zhù）釋比例統（tǒng）計、Uniprot注釋、KEGGPathway分類、Refseq注釋、Pfam結構域分類、COG 分類、TIGRFAMs注釋、CAZy數（shù）據庫注釋、ARDB數據庫注釋、CARD數（shù）據庫注釋（shì）、VFDB數據（jù）庫注釋、病原宿主互作分析、細胞色素 P450注釋、TCDB 轉運蛋白分類注、）基因豐度估計、差異基因（yīn）和富集（jí）分（fèn）析（基（jī）因豐（fēng）度整體情況——基因表達PCA圖和Pearson相關性圖、基因差異分析——差異基因（yīn）火山（shān）圖和差異基（jī）因（yīn）KEGG富（fù）集（jí）氣泡圖、物種豐度表——門綱目屬種、α多樣性、Aplha稀（xī）釋曲線、ANOSIM、PCA、PCoA &permanova、差（chà）異物種分析、LEfSe多級物種差異判別分析）

備注（zhù）：需添加宏基因組子繪圖功能

6.1.4宏基因（yīn）組醫學平台（tái）搭建的內容（róng）

下（xià）機數據（jù）跟數據庫進行（háng）比對，鑒定物種。

6.2 工作要求

6.2.1項目開（kāi）展過程中，由投標方提（tí）供（gòng）相關信（xìn）息起草編寫的高通量測序（NGS）分析係（xì）統方案。此類調整由（yóu）投標方體（tǐ）現在終（zhōng）版方案和項目報告中並郵寄給武（wǔ）漢公司。

6.2.2中標人不得中途退（tuì）標，中標通知書下達十日內，中標人必須與招標人依據招標文件的內容簽訂合同。否則（zé），招標人有權另行確定中標人（rén），並依照《中華人民共和國招標投標法（fǎ）》進行處（chù）置，並列入羞羞视频在线公司黑名單，三年內不得參與羞羞视频在线公司投標。合同簽訂後，本招標文（wén）件自然轉為合同附件，與合同（tóng）具有同等法律效力。

6.2.3投標單位應在規定時（shí）間完成所有工作，各項任務的完成節點以合同形式約定為準，如遇特殊情況，經雙方協商（shāng）後可順延。

7.報價方式

7.1投標人應提交已標價的報價。

報價表由以下（xià）部分組成，分別為：高通量測（cè）序（NGS）分析係統搭建的費用，報價表（biǎo）應包括本次招標全部內容的各項價格，並最終形成總價（jià），如有缺項或漏項，在項目實施過程中，招標人將不予支付，並認為此（cǐ）項費（fèi）用包含在總價中。

7.2投標人在服務期間的所有人員的交通、住宿和夥食費應含在總價中，招標人不（bú）再額外支付。

7.3投標人所報的相（xiàng）應分項的價格在合同實施期（qī）間應保持不變，並不（bú）因勞務、材料、機械、運（yùn）輸（shū）等成本的價格以（yǐ）及（jí）稅金等其它一切因素的變動而（ér）做任何調整。

8.特別說（shuō）明

承諾無故拖延項目完成一（yī）天，扣除全（quán）部（bù）報價的0.5%作為違（wéi）約金,拖延一周扣除全部報價的10%作為違（wéi）約金,拖延15天（tiān）扣除全部報價（jià）的20%作為違約金,30天解除合同，並承擔（dān）賠付責任。

9.報名方式

9.1報名截止日期： 2024年（nián）11月05日15點30

9.2報名資質：投標人（rén）需準備公司營業執照（複印（yìn）件加蓋公章）、資質證（zhèng）書（複印件加蓋公章）、相關業績、法人委托書（shū）、代理人身份（fèn）證。隻接受網絡郵箱報名，發郵件時（shí）在正文中填寫清楚參與報名單（dān）位名稱、報（bào）名事項及編號，聯係人及聯係方式。

9.3此（cǐ）項（xiàng）目（mù）評標標準是以低價優先原則做為商（shāng）務部分評選基（jī）礎，通過評（píng）委（wěi）綜合評選（xuǎn）後確定中標推薦人。

9.4投標書需準備3份，一正二副，標書裏需附有企業相關資質、業績、報價和技術方案等資料（liào），所有投標方製作標書中必須加入反商業賄賂承諾書。否（fǒu）則（zé）視為無效標書。（反商業賄賂承諾書在我（wǒ）公司官網首頁（yè）右下角可下載）

10.發布人：羞羞视频在线生物（wù）製品研究所（suǒ）有限責任公司

10.1聯係地址（zhǐ）：羞羞视频在线市江夏區黃金（jīn）工業園路1號（hào）武（wǔ）漢生物製品研（yán）究所有限責任公司

10.2聯（lián）係人：汪 洋

聯係電話（huà）：027-86637028

報名郵箱：wangyang16@sinopharm.com